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1、適用范圍和作用不同

項目申請報告是政府行政許可的要求，它僅僅適用于企業(yè)投資建設(shè)實行政府核準(zhǔn)制的項目，即列入“核準(zhǔn)目錄”的企業(yè)投資項目。其作用是根據(jù)政府關(guān)注的公共管理要求，主要從維護(hù)經(jīng)濟(jì)安全，合理開發(fā)利用資源、保護(hù)生態(tài)環(huán)境、優(yōu)化重大布局、保障公眾利益、防止出現(xiàn)壟斷等方面進(jìn)行核準(zhǔn)。政府投資項目和實行備案制的企業(yè)投資項目，均不需要編制項目申請報告。

2、目的不同

對于企業(yè)投資項目而言，可行性研究報告的目的是論證項目的可行性，提交企業(yè)內(nèi)部決策機(jī)構(gòu)(如企業(yè)董事會)審查批準(zhǔn)；以及提交貸款方(包括內(nèi)、外資銀行以及國際金融組織和外國政府)評估，以便其做出貸款決定。

頂目申請報告是對政府關(guān)注的項目外部影響，涉及公共利益的有關(guān)問題進(jìn)行論證說明，以獲得政府投資主管部門的核準(zhǔn)(行政許可)。在政府投資主管部門核準(zhǔn)之前，根據(jù)有關(guān)規(guī)定，企業(yè)需要獲得規(guī)劃、自然資源等主管部門的許可。

3、內(nèi)容不同

可行性研究報告不僅要對市場前景、技術(shù)方案、設(shè)備選型、項目選址、投資估算、融資方案、財務(wù)效益、投資風(fēng)險等方面進(jìn)行分析與研究；而且，要對政府關(guān)注的涉及公共利益的有關(guān)間題進(jìn)行論證。

項目申請報告主要是從規(guī)劃布局、資源利用、征地移民、生態(tài)環(huán)境、經(jīng)濟(jì)和社會影響等方面對擬建項目進(jìn)行論證，對市場、技術(shù)、資金來源、財務(wù)效益等不涉及政府公權(quán)力等“純內(nèi)部”問題， 不作為主要內(nèi)容，但需要對項目有關(guān)間題加以簡要說明，作為對項目核準(zhǔn)提供項目背景、外部影響評估的基礎(chǔ)材料。如：為了便于政府對發(fā)展規(guī)劃、產(chǎn)業(yè)政策及行業(yè)準(zhǔn)人等內(nèi)容進(jìn)行審查，需要對采用工藝技術(shù)方案的先進(jìn)性、創(chuàng)新性作簡要說明等。